Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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SPC24Q8NBT2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SPC24Q8NBT2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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SPC24Q8NBT2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPC24Q8NBT2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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