Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms