Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTC29Q8NA56 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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