Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms