Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD12Q8N8I0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms