Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSAMQ8N6F7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms