Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL34Q8N239 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms