Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP3Q8IZU3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms