Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms