Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms