Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC29A4Q7RTT9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC29A4Q7RTT9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms