Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms