Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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