Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
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