Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms