Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms