Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms