Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms