Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms