Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC62Q6P9F0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC62Q6P9F0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC62Q6P9F0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC62Q6P9F0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC62Q6P9F0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC62Q6P9F0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC62Q6P9F0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms