Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC4Q6P2E9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDC4Q6P2E9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms