Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms