Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms