Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCSAPQ6IQ19 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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