Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms