Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF18Q5VWM3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms