Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms