Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIF1Q5T3J3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIF1Q5T3J3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms