Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms