Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms