Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms