Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q56UQ5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q56UQ5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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