Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC92Q53HC0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC92Q53HC0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms