Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A12Q504Y0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms