Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms