Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms