Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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