Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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