Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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