Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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