Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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