Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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