Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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