Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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