Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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