Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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