Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EEA1Q15075 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms