Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
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