Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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