Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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